offener Betatest für neue cmsearch VM Anwendung

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yoyo
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Re: offener Betatest für neue cmsearch VM Anwendung

#61 Ungelesener Beitrag von yoyo » 11.09.2013 19:51

yoyo hat geschrieben:Aus irgendwelchen Gründen schickt er mir nix (hostid=21175).
Zu früh beschwert, jetzt schickt der scheduler doch was.

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Re: offener Betatest für neue cmsearch VM Anwendung

#62 Ungelesener Beitrag von yoyo » 11.09.2013 20:10

Ich habe Boinc auf 2 CPU beschränkt. Da wurden 2 VM gestartet. Dann hab ich Boinc auf 4 CPU gesetzt und er hat versucht 2 weitere VM zu Starten. Daran ist virtual Box dann immer wieder gescheitert, z.B. http://www.rnaworld.de/rnaworld/result. ... d=14919019. Nach mehreren Versuchen liefen dann 4.
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Re: offener Betatest für neue cmsearch VM Anwendung

#63 Ungelesener Beitrag von Norman » 11.09.2013 20:14

wie hast du es gelöst ?
einstellung geändert und dann boinc neu gestartet ?

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Re: offener Betatest für neue cmsearch VM Anwendung

#64 Ungelesener Beitrag von yoyo » 11.09.2013 20:18

Das geht ohne Boinc restart.
Assistenten-Einstellungen-Nutzung des Prozessors-Nutze auf multiprozessorsystemen höchstens XXX % der Prozessoren.
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Re: offener Betatest für neue cmsearch VM Anwendung

#65 Ungelesener Beitrag von Norman » 11.09.2013 20:20

ja das kenn ich aber warum macht dann VirtualBox zicken ?
wird die einstellung nicht sofort erkannt oder geht das ohne probleme ?
hab ich noch nicht getestet.

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Re: offener Betatest für neue cmsearch VM Anwendung

#66 Ungelesener Beitrag von yoyo » 11.09.2013 20:31

Mir ist noch was merkwürdiges aufgefallen:
i7, 8 Threads (mit HT) in Boinc aber nur 50% der Prozessoren, also 4 erlaubt.

Trotzdem zeigt mir der Taskmanager unter Win 7 100% Auslastung an und das System laggt ganz schön.

Im Taskmanager seh ich alle 8 threads nahezu 100% ausgelastet, wobei aber fast 50% Kernel Zeit ist.
Dateianhänge
t2.png
t2.png (77.91 KiB) 1981 mal betrachtet
t1.png
t1.png (117.82 KiB) 1981 mal betrachtet
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Re: offener Betatest für neue cmsearch VM Anwendung

#67 Ungelesener Beitrag von Norman » 11.09.2013 20:46

mmh, hast du mal probiert HT zu deaktivieren ?
systemload ?
scheint das die WUs sehr viel systembus (QPI/read/write/etc) benötigen.
der kernel muss soviel hin und herschaufeln.
nen versuch wärs wert mal HT zu deaktivieren und für ne vietel stunde das ganze zu beobachten. ?!
speichertakt evtl. mal dem spaß wegen erhöhen/reduzieren ?

Norman

Matthias Lehmkuhl
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Re: offener Betatest für neue cmsearch VM Anwendung

#68 Ungelesener Beitrag von Matthias Lehmkuhl » 11.09.2013 20:50

Ich habe noch eine Problem WU gefunden
cmsvm_GA-p[BR-Lin64f]_1_Bacillus-amyloliquefaciens-FZB42_CP000560.cir.EMBL_RF00025_Telomerase-cil_1378924326_25
http://www.rnaworld.de/rnaworld/workuni ... id=6330479

Momentan habe ich aber 3 Gute am laufen.
cmsvm_GA-p[BR-Lin64f]_1_Bacillus-amyloliquefaciens-FZB42_CP000560.cir.EMBL_RF00026_U6_1378924326_26
cmsvm_GA-p[BR-Lin64f]_1_Bacillus-amyloliquefaciens-FZB42_CP000560.cir.EMBL_RF00027_let-7_1378924326_27
cmsvm_GA-p[BR-Lin64f]_5_Bacillus-amyloliquefaciens-FZB42_CP000560.cir.EMBL_RF00031_SECIS_1378924326_34

vm laufen bei mir in der CPU Anzeige immer als Kernel Zeit
2 sind noch in der Pipeline
Matthias

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Matthias Lehmkuhl
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Re: offener Betatest für neue cmsearch VM Anwendung

#69 Ungelesener Beitrag von Matthias Lehmkuhl » 11.09.2013 21:01

noch eine die sofort beendet wurde
cmsvm_GA-p[BR-Lin64f]_4_Bacillus-amyloliquefaciens-FZB42_CP000560.cir.EMBL_RF00069_SNORD24_1378924326_71
http://www.rnaworld.de/rnaworld/workuni ... id=6330497
Matthias

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Re: offener Betatest für neue cmsearch VM Anwendung

#70 Ungelesener Beitrag von Stiwi » 11.09.2013 21:04

Ich hatte bisher 2 berechnungsfehler aber die dritte WU scheint zu laufen

http://www.rnaworld.de/rnaworld/result. ... d=14918876
http://www.rnaworld.de/rnaworld/result. ... d=14919200
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ChristianB
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Re: offener Betatest für neue cmsearch VM Anwendung

#71 Ungelesener Beitrag von ChristianB » 11.09.2013 21:31

Ich sehe da überall sehr lange Dateinamen und noch längere Pfade. Alle Problemfälle kriegen die VM ja noch nichtmal angelegt. Wir müssen also die Paketnamen unbedingt kürzer machen oder einen Linuxrechner finden der bei den Problemfällen das gleiche Problem hat (was ich aber nicht glaube).

Lassen wir die jetzt erstmal komplett durchlaufen und dann sehen wir weiter.

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Norman
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Re: offener Betatest für neue cmsearch VM Anwendung

#72 Ungelesener Beitrag von Norman » 11.09.2013 21:34

mmh, ich glaube mich zu errinnern dass bei windows bei 128 und bei linux 256 zeichen schluss war..
bin mir aber nicht mehr sicher..
sicher sind diese ellenlangen namen extrem lang und könnten durchaus mal gekürzt werden bzw. zusammengefasst werden.
das geht zwar zu lasten der information aber nicht zu stark eingeschränkt durchaus dennoch nützlich oder ?
was man gerade rechnet usw.
ob es sich bei der VB anders verhält oder ähnlich ?! keine ahnung aber denkbar ist es ;)

Norman
Zuletzt geändert von Norman am 11.09.2013 21:36, insgesamt 1-mal geändert.

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