Bester Candidate

Medikamentensuche durch "Docking"-Simulationen (Mapping Cancer Markers, FightAIDS@home, Smash Childhood Cancer, ...)
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naikan
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#13 Ungelesener Beitrag von naikan » 07.02.2004 18:02

Mein Bester bisher:

Name: IBS_STOCK1S-91103.pdbq
Target: TSC Target IV - FRAP
# of Top Conformers Found: 20
Discovered: 1/22/04 11:18 AM
Discovered by: Node 30653
Docking Time: 13 min, 04 sec
Avg Docking Time Per Top Conformer: 39.200 sec
Best Energy: -16.99 kcal/mol


Bin aber weider auf der Suche :D
Projekt: CommuntityTSC
Zweit Projekt: Grub

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lacer

#14 Ungelesener Beitrag von lacer » 07.02.2004 20:12

darksun hat geschrieben:Leider nur :(

Name: IBS_STOCK1S-93916.pdbq
Target: TSC Target V - AKT

Best Energy: -14.5 kcal/mol

Aber bin auch noch nicht mal 2 tage dabei :wink:
Ich hab -14.49 :( Bin seit Mittwoch oder so dabei ;)

darksun
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#15 Ungelesener Beitrag von darksun » 07.02.2004 20:52

Und schon wieder verbessert :smilered:

Name: IBS_STOCK2S-11486.pdbq
Target: TSC Target IV - FRAP
Discovered: 2/7/04 11:50 PM

Best Energy: -17.42 kcal/mol
Zuletzt geändert von darksun am 08.02.2004 09:50, insgesamt 1-mal geändert.
Bild

masel

#16 Ungelesener Beitrag von masel » 07.02.2004 21:34

Name: IBS_STOCK2S-45582.pdbq
Target: TSC Target IV - FRAP
Discovered: 2/7/04 2:26 PM
Best Energy: -16.61 kcal/mol :blush:

mal schaun ob man das nicht besser hinkriegt :onfire:

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frank
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#17 Ungelesener Beitrag von frank » 08.02.2004 02:38

Mein bester:

Name: IBS_STOCK2S-18938.pdbq
Target: TSC Target IV - FRAP
# of Top Conformers Found: 20
Discovered: 1/31/04 6:53 PM
Discovered by: Node 30967
Docking Time: 4 hr, 07 min, 56 sec
Avg Docking Time Per Top Conformer: 12 min, 23 sec
Best Energy: -17.54 kcal/mol

:D
frank
[edit] Kann mir mal jemand kurz erklären, warum es von Vorteil ist, wenn möglichst viel Energie frei wird?? :-?

masel

#18 Ungelesener Beitrag von masel » 08.02.2004 05:39

frank hat geschrieben: ...
[edit] Kann mir mal jemand kurz erklären, warum es von Vorteil ist, wenn möglichst viel Energie frei wird?? :-?
Die Energie die bei einer Verbindung frei wird braucht man genau so um sie wieder zu lösen. Wenn die freiwerdende Energie hoch ist ist es weniger wahrscheinlich das die benötigte Endergie zum lösen aufgebracht werden kann -> stabilere Verbindung.

Ticker

#19 Ungelesener Beitrag von Ticker » 08.02.2004 09:28

Name: IBS_STOCK1N-25750.pdbq
Target: TSC Target IV - FRAP
# of Top Conformers Found: 20
Discovered: 2/4/04 2:40 PM
Discovered by: Node 30667
Docking Time: 40 min, 35 sec
Avg Docking Time Per Top Conformer: 2 min, 01 sec
Best Energy: -19.5 kcal/mol


Gruß, Peter

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BrainMcFly
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#20 Ungelesener Beitrag von BrainMcFly » 08.02.2004 13:05

aus dspy:


Node: 31031
Bestes von 3096 Ergebnissen: 3 -249.46 am 18 Jan 2003 03:28 PM

darksun
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#21 Ungelesener Beitrag von darksun » 08.02.2004 13:27

BrainMcFly hat geschrieben:aus dspy:


Node: 31031
Bestes von 3096 Ergebnissen: 3 -249.46 am 18 Jan 2003 03:28 PM
:-?
Was soll das sein?

Best Candidate Found für 31031 ist

Name: IBS_STOCK1S-28613.pdbq
Target: TSC Target IV - FRAP
Discovered: 2/5/04 7:00 PM
Discovered by: Node 31031
Best Energy: -13.71 kcal/mol

Hast da wohl irgendwelche Werte durcheinander gewürfelt. :wink:

Oder ich stehe auf dem Schlauch :bugeye:
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#22 Ungelesener Beitrag von BrainMcFly » 08.02.2004 14:23

nö, steht bei dspy ganz oben so da, mir fällt aber gerade auf, dass tsc an dem tag noch nicht auf dem rechner lief, scheint sich also dspy zu irren...

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#23 Ungelesener Beitrag von VadderSchlumpf » 08.02.2004 14:33

ja, solche hatte ich auch schonmal, das war ungefähr vor nem halben jahr, da gab es bei PI3K so tolle werte :) z.zt. sind aber eher werte >-20 drin.

Dennis Kautz
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#24 Ungelesener Beitrag von Dennis Kautz » 08.02.2004 16:05

Dermassen hohe Werte werden leider nur durch korrupte WUs verursacht... Bei allem, das besser als -20 ist, wäre ist erstmal sehr skeptisch :-?

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